Новомученики, исповедники, за Христа пострадавшие в годы гонений на Русскую Православную Церковь в XX в. (с) ПСТГУ, ПСТБИ (с) Братство во Имя Всемилостивого Спаса
Тюменская о., г.Ишим, тюрьма Год начала1943 Месяц начала11 Омск, тюрьма Москва, Внутренняя, Лефортовская, Бутырская, Краснопресненская тюрьмы Год окончания1944 Месяц окончания7 Сибирские лагеря Год начала1944 Месяц начала8 Год окончания1946 Месяц окончания8
В лагере работал на полевых работах, затем ассенизатором.
После прихода к правлению Патриарха Алексия I епископ Афанасий примирился
с Московской Патриархией, однако еще много лет оставался в заключении. Он писал: "Когда в 1945г., будучи в заключении, я и бывшие со мною иереи, не поминавшие митр.Сергия, узнали об избрании и настоловании Патриарха Алексия, мы, обсудивши создавшееся положение, согласно решили, что так как кроме Патриарха Алексия, признанного всеми Вселенскими Патриархами, теперь нет иного законного первоиерарха Русской Поместной Церкви, то нам должно на наших молитвах возносить имя Патриарха Алексия, как Патриарха нашего, что я и делаю неукоснительно с того дня"